A történetben Timmy Turner iskolájában tudományos kiállítás készül, ám ő nem tud semmit felmutatni, ezért tündéreivel a világ legokosabb emberének laborjába kívánja magát. A kívánság hatására Timmy egy másik világba kerül, Jimmy Neutronéba, akinek robotkutyáját, Goddardot véletlenül egy óriási szörnykutyává változtatja, Jimmy pedig átkerül Timmy világába, ahol balszerencse folytán Timmy gonosz tanára, Mr. Crocker megszerzi Jimmy egyik találmányát és mindannyian Tündérországba kerülnek, ahol Crocker átveszi a hatalmat. Timmynek le kell győznie a szörnykutyát, Jimmynek pedig Crockert.